开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)
课题的研究背景:
随着全球人口的增加和老龄化的加重以及致癌行为的发生如抽烟,尤其是在经济发展中国家,癌症带来的重担在不断加增。乳腺癌是妇女常见的恶性肿瘤, 在欧美国家的发病率占女性恶性肿瘤的首位[1]。根据2008年的统计分析,在女性癌症患者中23%患有乳腺癌,死亡率达到14%[2]。乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤,在我国乳腺癌也严重威胁着女性的健康[3]。近几年乳腺癌的诊疗取得了巨大的进展,各种新药层出不穷。药物治疗是乳腺癌临床治疗中的重要部分[4]。而每个药物都有相应的作用靶点。药物作用靶点是药物与之作用可产生药理学作用并达到防治疾病目的,由生物分子形成的特殊位点,是药物发挥作用的基础[5]。由于药物靶点研究是现代新药研发的源头,可以为重大疾病的防治提供重要信息,使基于新靶点的新药研发具有重大社会效益和经济效益,因此药物靶点成为当今医药领域的研究热点。随着生命科学和生物信息学的快速发展,科学家已积累了大量药物靶点的相关数据,越来越多的靶点结构得到解析,使药物靶点数据库的构建成为可能[6]。
课题的目的和意义:
本次毕业设计旨在收集抗乳腺癌药物的靶点信息并建立一个专门的靶点数据库。由于抗乳腺癌药物的靶点信息分散在不同文献和相关的公共数据库中,对数据的收集和整理成为必要。希望通过建立一个专门的抗乳腺癌药物的靶点数据库供研究人员更为方便查找抗乳腺癌药物的靶点信息或者通过整合后的数据使用相关的算法和工具来挖掘出药物作用靶点的规律,为药物的合理使用提供参考。同时希望通过本次数据库的建立能够更为深入了解数据库的结构、建立的方法、数据库的优化以及如何合理的存储和组织生物数据继而如何高效地处理和获取数据。学习生物信息例如生物大分子的结构信息、序列信息如何在数据库中表示和存储,为以后进一步的研究打下一个基础。
国内外研究概况:
随着早期诊断的普及,综合治疗的完善和预后及预测模型的确立,乳腺癌的死亡率明显下降。药物治疗在乳腺癌的临床治疗中发挥着重要的作用[3]。无论是化疗,内分泌治疗还是靶向治疗均取得一定程度的进展。例如乳腺癌的分子靶向治疗取得了令人瞩目的进展,是近年来乳腺癌治疗研究最为活跃的领域, 并有可能成为今后乳腺癌药物研究的主要方向[7]。近年来我国学者对疾病靶点的研究进展令人瞩目,这大大促进了我们对各类疾病的认识,为推进中国新药研发奠定了基础,一些疾病靶点在将来有可能成为新的药物作用靶点[5]。得益于高通量和低成本的DNA测序技术,生物数据在大规模的积累并以指数倍增加[8]。随着越来越多靶点信息的累积,国外建立了许多成熟的靶点数据库。这些药物靶点数据库的共同特点是收录的靶点信息比较全面,涵盖面广,按合理的标准进行了分类,采用多种关键词检索方式,并广泛地与其他生物信息学数据库链接,便于获取丰富的靶点信息[6]。如,TTD,该库收集了2 000 多个靶点信息,包括已有药物上市的药物靶点、正在研究的、临床试验阶段的、以及已停止的靶点信息。像DrugBank[10],该库信息分为药物信息和靶点信息两大部分,其中药物靶点信息涉及靶点的序列、结构及通络。这些药物靶点数据库所整理的数据各有侧重,科研工作者应根据自己的需要,选用不同的数据库。与国外药物靶点数据库相比较,国内的药物靶点数据库中的靶点尽管数据类别很多,但是数据信息更新与维护有待于提高。此外,在数据形式多元化、数据可视化以及数据挖掘方面也略显不足[6]。药物靶点数据库不应局限于数据的收集,应该通过数据挖掘来发现一些靶点与配体的作用规律。
课题的研究方法和内容:
对于药物靶点信息的收集主要通过查阅文献和参考公共的靶点数据库来获得。查阅中文文献主要通过中国知网,查阅外文文献主要使用PUBMED,Google学术和《Elsevier电子期刊全文》等。可供参考的靶点数据库有DrugBank,TTD,SuperTarget,PDTD等。每个数据库收录的靶点信息侧重不一样,还需要根据课题的需要进一步整理。将收集到的靶点信息整理好之后基于SQL Server 建立关系型数据库,为进一步的研究奠定基础。
研究中用到的技术和可能存在的问题:
以上是毕业论文文献综述,课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。