构建自抗基因导向的产萜基因簇挖掘平台文献综述

 2023-04-19 06:04

文献综述

1.生物合成基因簇天然产物(Natural Products)NPs,是由生物体以特殊方式产生的基因编码的小分子,其研究涉及分子结构、生物合成和生物活性1。

来自微生物的NPs在工业、农业和生物医学应用中表现出极大的重要性2。

生物合成基因簇(biosynthetic gene clusters)BGC:由遗传分析表明,天然产物通常由一组基因合成,这些基因在空间上聚集在细菌基因组的某一位置。

这样一组基因被称为生物合成基因簇(BGC)。

这种遗传结构的提出,为通过定位其基因簇,准确地检测天然产物的生物合成途径提供了可能。

一个BGC通常负责产生一种或者几种具有生物活性的相似化合物3。

由于来自环境中的大量微生物未被培养,开采生物基因簇(BGCs)以生产新型的NPs一直受到阻碍。

在过去的十年中,随着高通量测序技术和强大的生物信息学数据处理工具的快速发展,建立了直接从(元)基因组中探索BGCs的策略,这大大加快了从未培养的微生物(包括嗜极性微生物)中开发新的BGCs。

2.生物合成基因簇的鉴定大部分工具直接从微生物基因组中识别BGCs。

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