基于自然语言处理技术的药物知识库互联互通文献综述

 2023-10-25 07:10

文献综述

(一)课题研究的现状分析和发展趋势

当今时代,信息环境的网络化,数字化极大地改变了图书馆传统服务的资源结构和业务运作方式。用户对图书馆传统服务的依赖程度在逐步减小,不再简单地获取文献,而是需要图书馆针对用户的具体问题和个性化环境,提供帮助用户解决实际问题的服务。作为一种适应用户需求变化的创新服务模式,知识服务数据化已成为关注的焦点。

而现在在网络上有关药物的数据库很多。在国内, 有国家发展和改革委员会医药工业信息中心站和上海数图医药科技有限公司建立的中国医药数字图书馆, 可提供批准新药、批准临床药品、行政保护药品、医药生产企业、药品标准的查询, 但内容信息局限于国内信息; 在国外, 医药信息网( www.pharmweb.net) 是第一个是在Internet 上提供药学信息服务的机构, 是目前药学面的重要网站, 有药品数据库、疾病数据库、新药数据库、医药市场等主要数据库。但到目前为止, 能够将药物信息与药学信息结合起来, 特别是将药物行政管理信息和药物合成工业信息结合起来的信息源或知识库还不多见。药物知识库就是基于这种背景而开发的。

药品管理信息查询通过自储和链接的信息资源, 将可查询线索进一步扩展到 1991 年以来 FDA 批准的所有药物和医疗器械, 并汇集了重要的药品管理机构站点; 海洋生物制药信息栏目专门提供海洋药物资源及其研究进展信息; 药学文献资料汇编是多年积累的有关药物的原始文献资料; 药学虚拟图书馆栏目将全球化的虚拟图书馆系统中的药学虚拟图书馆推荐给用户; 免费信息资源导航提供的是医药、化工方面免费资源的分类导航; 几种必备软件简介栏目介绍了几种利用网络信息、知识的常用软件; 网上信息查询方法栏目提供了医药化工网上信息检索及利用的网络版教程。

医药学知识资源是从事医疗,科研,教学以及医疗管理人员和医学院学生必不可少的,是医学工作者学习医学知识,查找治病根据,解决医学问题的“老师”。当今世界医学信息数量巨大,因信息形式的多样,来源的额广泛,质量的良莠不齐,给使用者查找带来了麻烦和困难。数字图书,电子期刊,综合医学网站和专业医学网站,各种专题数据库等虽然为医学网站和专业医学网站,各种专题数据库等虽然为医学工作者提供了信息检索的方法,途径等,但还是满足不了广大医学工作者的要求,更满足不了医学事业发展的需要。于是联通医药学知识库,扩增药物信息,开展新的服务模式,更好地为医学事业服务是医学信息机构的重要任务。

(二)课题研究的意义和价值

目前,国内外药物数据库数量繁多,无论是用户还是医护工作者若需要关于药物的多方面信息,便不得不实行跨平台检索。本项目主要介绍并实现一个可联立多个国内外药物知识库的信息系统。我们使用中国疾病知识总库CDD(ChinaDiseaseKnowledge Total Database)数据库,NCCD(National Center for Chornic Disease Control)数据库和RXNORM美国药物知识数据库,组合成一个基于web应用的原型知识库,主要通过药物编码来实现在多个库中的搜索结果。

设计实现这一系统的主要目的是允许用户通过搜索药物编码或者药物名称来更方便地查询有关药物的中英文名词,中英文注释以及不同剂量的效果。本项目使用python爬虫技术,结合xpath读取三个药物数据库的数据。以excel为基础平台,利用python的pandas库以及sas将目的数据库进行互联互通。

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